《小星猫魔幻乐章》讲述了因为一场大病，喜爱音乐的符小音被送到乡下的姥姥家生活，直到六年级健康恢复后，小音才转学回到大都市(明日市)的知名音乐学校。小音很高兴与好友乐思涵重逢，但新的学园生活，也对小音产生不少困扰。某天，她在回家的路上救了一只小猫自称为“星猫”的音乐精灵。因胆小而无法发挥自己音乐天赋的小音，为了不让心爱的音乐从世上消失，必须帮助星猫在三个月内，收集散落在人间的13个音符小小仙。在这段时间中，小音遭遇的许多磨练，友情以及才能都受到考验，但最终随着小音学习成长，克服缺点而更为独立坚强，最终不仅拯救了世界的音乐，更发挥自己的音乐才能，成为明日环球博览会开幕音乐的演奏候选人。